По всей вероятности, земляное укрепление не оставалось пустым слишком долго. В ходе раскопок, проведённых в XX в., в его меловой почве были обнаружены отверстия, в которых раньше стояли деревянные столбы различного размера. Возраст нескольких удалось определить и, хотя на иллюстрации сверху они все изображены вместе, как составляющие деревянной фазы Стоунхенджа, предшествующей установке камней, возможно, что некоторые столбы относились к более поздним этапам строительства.

По внутренней кромке насыпи на равном расстоянии располагались 56 отверстий Обри, в которых могли находиться деревянные столбы или (как предполагали некоторые из первых археологов, и как стали считать после повторной раскопки одного из них в 2008г.) небольшие вертикально стоящие камни.

Внутри и снаружи у главного входа были установлены равномерные ряды столбиков меньшего размера; также и от второго, южного входа к центру тянулись параллельные ряды близко посаженных столбиков, которые, возможно, являлись частью некого огороженного коридора. Именно там, в центре, разумно было бы искать наиболее значительные деревянные постройки. К сожалению, позднее установка камней стёрла слабые отпечатки столбовых отверстий. По оставшимся следам нельзя даже определить, было ли это одно круглое сооружение или несколько прямоугольных конструкций.




Вполне определённо то, что на этом этапе Стоунхендж стал местом захоронений. В ходе раскопок было обнаружено множество кремированных человеческих останков, почти все с наружной стороны вокруг укрепления: в полузасыпанном рву, внутри самой насыпи и в верхней части отверстий Обри, в которых к тому времени, вероятно, уже не было столбов.




Большинство захоронений нашёл в 1920-х годах полковник Вильям Хоули. В 1935 его помощник, Роберт Ньюалл, не понимая значения этих останков, снова закопал их в одной из срытых ранее лунок Обри. Так как во многих захоронениях сохранились пепел и угли из погребальных костров, можно предположить, что кремация проходила где-то неподалёку. Кроме останков, туда помещали и некоторые предметы, а также, по всей видимости, вместе с телами сжигали инструменты из рогов и костей животных. Была обнаружена и полированная каменная голова булавы, представляющая, очевидно, большую ценность.